いろいろ苦労しましたが、Mac OSX上でCrystFELが動くようになりました。下の画像は例題のタンパク質のX線回折パターンをシミュレーションしたものです。とりあえず良かった。
続きを読む CrystFELなんとか動くようになりました
IBMの研究者が作った世界で最も小さなムービー
まずはIBMのページに行って動画を見て下さい。銅の表面に吸着した一酸化炭素分子(CO)で描かれた少年が原子と戯れる動画です。一つ一つの明るい点がCO分子1個に対応します。
IBMの研究者は走査トンネル顕微鏡(STM)という装置を使って、銅の表面に吸着したCO分子を一個一個動かしならがら、コマ撮りしてこのムービーを作成しました。いったいどのくらいの時間がかかったのでしょう。大変な作業です。
下の方にはどうやって原子やCO分子を動かすのかを解説した動画もあります。英語ですが、人の顔が映っているところはすっ飛ばしても良いので(IBMの皆様ごめんなさい)是非ご覧下さい。
by Tadashi
連休終わりました
連休が終わると、なんとなくやる気が出なくなったりします。いわゆる5月病といわれるやつです。目標を持って、目の前のことを一つ一つこなして行くことで、5月病をやっつけましょう。
と自分に言い聞かせて、授業の準備等をこつこつとやってます。
CrystFELのインストール
最近、X線自由電子レーザーというものが開発されて各国で使用が開始されています。これにより、非常に短い時間だけ発光する強いX線のレーザーが使えるようになりました。このX線を使用すると、化学反応などの時に非常に短い時間に起こる分子の変形などを、まるで映画を見ているかのようにスローモーションで観測できるようになると期待されています。日本でも兵庫県にSACLAという世界最高性能を持つX線自由電子レーザーが完成し、共用が開始されています。
*X線自由電子レーザー( X-ray Free Electron Laser)はXFELと略します。SACLAの発光時間は約十フェムト秒(100兆分の1秒)で、光でもたった3μmしか進めないぐらいの短い時間です。原子の動きは、ほとんど止まって見えます。
当研究室も、表面構造解析で培った経験を生かすべくSACLAのプロジェクトの一つに参加させていただいております。当研究室の役割は、光照射などによって変化するナノ結晶のX線回折データの解析です。
National Holiday until Next Monday
Our lab. takes the holiday until the next Monday, May 6th.
We’ll be back to lab. from May 7th.
by Tadashi